問題1.メチルシクロヘキサン
(1,3-ジアキシャル相互作用の大きさを計算してみる)



1)メチルシクロヘキサンの組立
【エクアトリアル形】

1)「ファイル」の「テンプレート」から「cyclohexane」を選択.画面にシクロヘキサンが表示される.


2)「コントロールパネル」ウインドウで適当に分子を回転させる.

3)「組立」メニューから,「入力」−>「原子種変更」を選択.

4)「元素記号か原子番号を入力」 6又はC(炭素)を入力.

5)エクアトリアル水素をクリックすると,炭素に置き換わる.

6)「組立」メニューから,「入力」−>「水素付加」を選択.

7)「水素入力」ウインドウの設定はそのままでよい.先ほど変換した炭素をクリックすると・・・・.

8)水素が付加されて,メチルシクロヘキサンのエクアトリアル形が出来上がり.

9)「ファイル」メニューから,「エクスポート」−>「TINKER」を選択して,TINKER形式での保存を行う.「スタート」−>「bio」から,「TINKER」を起動してブタンと同様に,TINKERで分子力場計算を行いなさい.Final Function Valueをメモしておくこと(課題で使用).



アキシャル形についても,同様に分子を組み立て,計算を行うこと.

【課題】